仏教では死を穢れと扱いませんが、神道では死を穢れ（気枯れ）として扱うため、その慣習で穢れを祓うために塩を撒きます。

古事記によると、イザナキが黄泉の国から帰った際に穢れを祓うため、海水に浸ったことが始まりとされています。
これを禊と言います。その時、肩まで浸かったことから、今でもその名残でお塩を肩にかけるようです。